GPGPU-basierte Echtzeitdetektion von Nanoobjekten mittels Plasmonen-unterstützter Mikroskopie

نویسندگان

  • Frank Weichert
  • Constantin Timm
  • Marcel Gaspar
  • Alexander Zybin
  • Evgeny L. Gurevich
  • Heinrich Müller
  • Peter Marwedel
چکیده

Kurzfassung. Die Verfügbarkeit echtzeitfähiger und mobiler Biosensoren gewinnt durch die zunehmende Verbreitung viraler Infektionen zunehmend an Bedeutung. Im Gegensatz zu Virusdetektionsmethoden wie beispielsweise ELISA erlaubt die neuartige Plasmonen-unterstützte Mikroskopie von Nanoobjekten, Proben innerhalb von wenigen Minuten auf Viren analysieren zu können. Die Herausforderung für ein, auf dieser Analysemethode beruhendes In-situ-Virusdetektionssystem, besteht in der Echtzeitverarbeitung von extrem hohen Datenmengen. Hier setzt die vorliegende Arbeit an, welche eine hoch parallele GPU-basierte Verarbeitungspipeline zur echtzeitfähigen Virusdetektion vorstellt. Durch die konsequente Ausnutzung der GPGPU-Fähigkeiten von Grafikkarten kann auf teure Spezialhardware verzichtet werden, um eine echtzeitkonforme Beschleunigung notwendiger Bildverarbeitungsund Bildanalysealgorithmen bereitzustellen, die auch den Anforderungen an ein eingebettetes Virusdetektionssystem gerecht wird.

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تاریخ انتشار 2011